Os Projetos de Pesquisa são um espaço privilegiado para realizar os princípios pedagógicos gerais da Escola e do nível. As principais características do trabalho com projetos no Ensino Médio são: o reconhecimento da mutabilidade do conhecimento; a noção de conhecimento como diálogo; a busca da autonomia do aluno; o valor da problematização; o recurso constante à investigação; as mesclagens disciplinares). Os Projetos de Pesquisa permitem abordar conteúdos e realizar discussões que não têm espaço assegurado na grade regular; além disso, têm capacidade de absorver mais rapidamente e com mais profundidade os temas que emergem no cotidiano.